CAPSID PROTEIN P24

Protein Family Details

  Property   Value
 Name CAPSID PROTEIN P24
Family ID 6569_m
First Chain 1afv (A)
  No of Chains 23
  No of Clusters 2
  No of Rep. Chains 22
  No of Dimensions 1
No of Domain Movements 0

Clusters

Cluster ID Diameter (A) No of Chains Representative Members
1 0.02 2 1afv(A) 1afv(A)  1afv(B) 
2 0.64 21 Extended 1ak4(C)  1ak4(D)  1m9c(C)  1m9c(D)  1m9d(C)  1m9d(D)  1m9e(C)  1m9e(D)  1m9f(C)  1m9f(D)  1m9x(C)  1m9x(D)  1m9x(G)  1m9x(H)  1m9y(C)  1m9y(D)  1m9y(G)  1m9y(H)  2gol(B)  2gol(D)  2gon(B) 

Dimensions

Dimension ID Chain 1 Chain 2 Dyndom Run
1 (Vector: v1) 1afv (A) 1m9y (C) false

Associated Chains for 1-dimension

Chain ID Protein Name Sequence Length Resolution Cluster ID Projection
2gon (B) Capsid protein p24 (CA) 129 1.9 2 0.76v1
1m9f (C) HIV-1 Capsid 146 1.73 2 0.96v1
1m9x (C) HIV-1 Capsid 146 1.7 2 0.99v1
1m9e (C) HIV-1 Capsid 146 1.72 2 0.95v1
1m9d (D) HIV-1 Capsid 146 1.9 2 0.85v1
2gol (B) Capsid protein p24 (CA) 135 2.2 2 0.83v1
1m9x (H) HIV-1 Capsid 135 1.7 2 0.73v1
1m9y (H) HIV-1 Capsid 135 1.9 2 0.73v1
1m9x (D) HIV-1 Capsid 135 1.7 2 0.71v1
1m9y (D) HIV-1 Capsid 135 1.9 2 0.69v1
1m9e (D) HIV-1 Capsid 135 1.72 2 0.73v1
1m9f (D) HIV-1 Capsid 135 1.73 2 0.78v1
1m9c (D) HIV-1 Capsid 136 2 2 0.7v1
1ak4 (D) HIV-1 CAPSID 145 2.36 2 0.73v1
2gol (D) Capsid protein p24 (CA) 135 2.2 2 0.64v1
1m9d (C) HIV-1 Capsid 146 1.9 2 0.69v1
1m9c (C) HIV-1 Capsid 146 2 2 0.97v1
1ak4 (C) HIV-1 CAPSID 145 2.36 2 0.97v1
1m9x (G) HIV-1 Capsid 146 1.7 2 0.98v1
1m9y (G) HIV-1 Capsid 146 1.9 2 0.96v1
1afv (A) HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 CAPSID PR 151 3.7 1 0
1m9y (C) HIV-1 Capsid 146 1.9 2 1.0v1